Bộ Tiêu chí Nhãn Bông sen xanh có sự kết hợp giữa tiêu chí Du lịch bền vững Toàn cầu (GSTC) với các Tiêu chí đánh giá chất lượng môi trường, thể hiện tính thực thi của Nhãn tại Việt Nam, hướng tới hội nhập quốc tế, đáp ứng yêu cầu phát triển du lịch bền vững của thế giới, được sắp xếp thành 4 nhóm chính:
Nhóm A: Quản lý bền vững
Nhóm B: Tối đa hóa lợi ích kinh tế và xã hội cho cộng đồng địa phương
Nhóm C: Giảm thiểu các tiêu cực tới di sản văn hóa, di sản thiên nhiên
Nhóm D: Giảm thiểu những tác động tiêu cực tới môi trường